Aký je rozdiel medzi 16s rRNA a 18s RRNA?
Aký je rozdiel medzi 16s rRNA a 18s RRNA?

Video: Aký je rozdiel medzi 16s rRNA a 18s RRNA?

Video: Aký je rozdiel medzi 16s rRNA a 18s RRNA?
Video: Gravel vs. cyklokros - kde je rozdiel? 2024, November
Anonim

Hlavný rozdiel medzi vykonávanie analýz s 18S rRNA namiesto génových údajov 16S rRNA génové údaje (alebo údaje ITS) sú referenčnou databázou používanou na výber OTU, taxonomické priradenia a vytváranie zoradenia na základe šablón, pretože musia obsahovať eukaryotické sekvencie.

Vzhľadom na to, prečo sa na identifikáciu používa gén 16s rRNA?

The 16S ribozomálny RNA gén kóduje zložku RNA podjednotky 30S bakteriálneho ribozómu. Kvôli zložitosti hybridizácie DNA-DNA, 16S rRNA gén sekvenovanie je použité ako nástroj na identifikovať baktérie na druhovej úrovni a pomáhajú pri rozlišovaní medzi blízko príbuznými bakteriálnymi druhmi [8].

Okrem toho majú eukaryoty 16s rRNA? The 16S rRNA gén je prítomný vo všetkých baktériách a príbuzná forma sa vyskytuje vo všetkých bunkách, vrátane buniek z eukaryoty.

Otázkou tiež je, čo je 18s a 28s rRNA?

The 28S / 18S ribozomálna RNA pomer sa často používa na hodnotenie kvality celkovej RNA purifikovanej z akejkoľvek danej vzorky. u ľudí, 28S rRNA má ~ 5070 nukleotidov a 18S má 1869 nukleotidov, čo dáva a 28S / 18S pomer ~2,7. Výška 28S / 18S pomer je indikáciou, že purifikovaná RNA je neporušená a nedegradovala.

Čo je sekvenovanie 16s rRNA?

16S rRNA gén sekvencie analýza je štandardná metóda v bakteriálnej taxonómii a identifikácii a je založená na detekcii sekvencie rozdiely (polymorfizmy) v hypervariabilných oblastiach 16S rRNA gén, ktorý je prítomný vo všetkých baktériách.

Odporúča: